前沿交叉科学技术研究院支撑建设的国家级及省部级科研平台分别是新金属材料国家重点实验室、北京材料基因工程高精尖创新中心、新能源材料与纳米技术北京市重点实验室、功能性纳器件基础与应用国际合作基地、先进绿色微纳能源系统北京市国际科技合作基地与高校纳米科技创新战略联盟。